Re: bioenergetyka: czy cząsteczki

Lamesz <lamesz@onet.eu> napisał(a): 

> Witam!

Witam!
Odpowiem Ci, chociaż jestem chemikiem, ale w końcu termodynamika jest jedna :)
 
> Czytam właśnie o powodach, dla których hydroliza ATP wiąże się z 
> uwolnieniem tak znacznej ilości entalpii swobodnej. W Biochemii 
> Lehningera (nie wiem, jak jest gdzie indziej) wymienione są trzy powody:
> * likwidacja odpychania między ładunkami ujemnymi w resztach fosforanowych;
> * wysoka stabilność P_i spowodowana rezonansem;
> * fakt, że ADP błyskawicznie jonizuje, uwalniając H+ do roztworu o 
> niskim stężeniu H+.

Samorzutne zachodzenie procesów zależy od znaku funkcji termodynamicznej G 
(entapii swobodnej) wyliczanej jako delta H - T * delta S, gdzie:
 - delta H (zmiana entapii podczas reakcji) - w uproszeniu róznica między 
energią produktów i energią substratów. Jak jest ujemna to sprzyja 
zachodzeniu reakcji w strone produktów (z lewej strony na prawą) - 
spowodowane jest to korzystniejsza konfiguracją ekelktronową produktów niż 
substratów. To by tłumaczyło dwa pierwsze powody z Twojego podręcznika.
- T - temperatura w stopniach Kelvina
- delta S (zmiana entropii podczas reakcji) - odpowiednio jak w przypadku 
entapii. Tutaj z kolei ważny jest wzrost entropii (entropia produktów większa 
niż substaratów). możesz przyjac, ze jak z jednej czasteczki (ATP) powstaje 
dwie (ADP i reszta fosforanowa i jeszcze dlasza dysocjacja ADP) to entropia 
rośnie (dalsze wyjaśnienia w podręcznikach termodynamiki). A to z kolei byłby 
trzeci powód.

> Problem jest taki: pomijając punkt 1, jak należy tu rozumieć 
> "przyczynowość"? O ile rozumiem, zmiana entalpii swobodnej wpływa na 
> "skłonność" do zachodzenia określonej reakcji - w jaki jednak sposób 
> można mechanistycznie wytłumaczyć zwiększenie skłonności do zachodzenia 
> reakcji A poprzez cechy produktów tej reakcji?

Wyjaśnienia w części dotyczącej delty H (korzystna konfiguracja elektronowa 
produktów).

> Skąd cząsteczka ATP 
> "wie", że jej produkty będą posiadały określone własności 
> termodynamiczne? Czy to jakoś "wychodzi" w trakcie zachodzenia tej reakcji?

Uuuuu, bo zaraz zacznie się dyskusja światopoglądowa i flame "na grupie".
 
> A może chodzi o to, że delta H nie ma wpływu na energię aktywacji? 
> Zaplątałem się i byłbym wdzięczny za pomoc.

Delta H (efekt energetyczny reakcji) nie ma wpływu na energię aktywacji.

> Pozdrawiam,
> Lamesz

Pozdrawiam i życzę zwycięskiego "borykania się" z problemem,
alburnus


-- 
Wysłano z serwisu Usenet w portalu Gazeta.pl -> http://www.gazeta.pl/usenet/