An update on tumor suppressor genes in breast cancer.

An update on tumor suppressor genes in breast cancer.
par Marc Lacroix
InTextoResearch, Baelen (Wallonie), Belgique
chapitre paru dans Tumor Suppressor Genes, Nova Sciences Publishers,
ISBN 1-60021-693-5 (2007), pp. 177-251


   Breast cancer is characterized by the accumulation of genetic
alterations, including point mutations and loss of entire DNA regions
("loss of heterozygosity" or LOH). Among genes that are affected by
such events, the "tumor suppressor genes" (TSGs) have a peculiar
interest since they often occupy pivotal positions in regulatory
networks that control the cell cycle and/or encompass various signal
transduction cascades. While a number of genes have been suggested as
candidate TSGs in breast cancer, only a few of them have been
confirmed in this status. They include TP53, BRCA1, BRCA2...and are
mainly involved in the control of DNA repair, cell proliferation,
apoptosis and signaling. Some TSGs are linked to familial (hereditary)
forms of breast cancer. The exact definition of what is a TSG is still
debated. Recently, genes not affected by mutation or even LOH, but
occasionally methylated have been considered as TSGs.


Résumé en français:
(Le cancer du sein est caractérisé par l'accumulation d'altérations
génétiques, incluant des mutations ponctuelles et la perte de régions
entières d'ADN. Parmi les gènes affectés par de tels événements, les
"gènes suppresseurs de tumeurs" (GSTs) présentent un intérêt
particulier du fait que les protéines qu'ils codent sont des "pivots"
dans les réseaux  régulateurs du cycle cellulaire ou des membres
importants de cascades de transduction de signaux intracellulaires.
Alors que le nombre de "candidats GST" ne cesse de croître, seuls
quelques-uns ont été à ce jour confirmés dans cette fonction. Ils
incluent TP53 (qui code pour la protéine p53), BRCA1 et BRCA2 (codant
pour les protéines de même nom) et sont principalement impliqués dans
le contrôle de la réparation de l'ADN, de la prolifération cellulaire,
de l'apoptose, et de la signalisation intracellulaire. Certains GSTs
sont associés aux formes "familiales" ou "héréditaires" du cancer du
sein. En fait, la définition exacte d'un GST fait encore l'objet de
débats et, récemment, certains gènes non affectés par des mutations
mais occasionnellement méthylés ont été considérés comme GSTs).


Liste des gènes examinés:


Sur le chromosome 1: CLCA2, DIRAS3 (ARHI, RHOI, NOEY2), LPHH1, TTC4,
RAD54L (RAD54), FABP3 (MDGI), RUNX3 (CBFA3, AML2), PRDM2 transcript 1
(RIZ transcript 1), SFN (14-3-3s)

Sur le chromosome 3: ROBO1 (DUTT1), PTPG (PTPRG); FHIT (FRA3B,
included), PB1 (BAF180), RASSF1 transcript A, RBM5 (LUCA-15, H37),
TUSC4 (NPRL2), TMEM158 (RIS1), SEMA3B, TGFBR2 (HNPCC6), APRG1
(C3ORF35), RARB transcript 2, VHL, ATR (FRP1)

Sur le chromosome 4: SLIT2, PRDM5, HPGD (PGDH1)

Sur le chromosome 5: DAB2 (C9), APC, IRF1

Sur le chromosome 6: PLAGL1 (ZAC, LOT1), LATS1 (WARTS), IGF2R (MPRI)

Sur le chromosome 7: ST7 (TSG7, RAY1, FAM4A1, HELG)

Sur le chromosome 8: SFRP1 (FRP), DLC1 (ARHGAP7), BNIP3L, RHOBTB2
(DBC2), LZTS1 (FEZ1, F37), MTUS1 (ATIP), MCPH1 (BRIT1), ST18

Sur le chromosome 9: CDKN2A (p16INK4A, p14ARF), SYK, DAB2IP (AIP1),
TSC1

Sur le chromosome 10: PTEN (MMAC1), PDCD4, MGMT

Sur le chromosome 11: WT1, TSG101, CDKN1C (BWS), CST6, IGSF4 (TSLC1,
ST17, NECL2), ATM, LOH11CR2A (BCSC1)

Sur le chromosome 12: CCND2

Sur le chromosome 13: LATS2, BRCA2 (FANCD1), RB1, ARL11 (ARLTS1)

Sur le chromosome 15: RAD51 (RECA)

Sur le chromosome 16: TSC2, CYLD, CTCF, CDH1, TERF2 (TRF2), TERFIP,
FBXL8, LRRC29, ATBF1, WWOX, FBXO31, CBFA2T3 transcript B (MTG16),
CPNE7, CDK10 (PISSLRE), FANCA, GAS11, C16ORF3

Sur le chromosome 17: MAP2K4 (SERK1, SEK1, PRKMK4, MEK4), GABARAP,
TP53,
IC1, OVCA1(DPH1, DPH2L1), BRCA1, BECN1, SLC9A3R1

Sur le chromosome 18: EPB41L3, SMAD4 (ELAC1, DPC4), DCC

Sur le chromosome 19: STK11 (LKB1)

Sur le chromosome 22: SMARCB1 (BAF47, SNF5), RRP22, TMPRSS6, CHEK2
(CHK2, RAD53), NF2, PRR5